Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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