Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps11P62281 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps11P62281 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps11P62281 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms