Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms