Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ube2d3P61079 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube2d3P61079 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube2d3P61079 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube2d3P61079 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube2d3P61079 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube2d3P61079 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube2d3P61079 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube2d3P61079 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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