Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdo1P60334 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms