Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms