Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhbdl3P58873 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl3P58873 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms