Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tpm2P58774 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm2P58774 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms