Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NcstnP57716 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcstnP57716 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcstnP57716 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms