Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp25P57080 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms