Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdgP56581 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdgP56581 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TdgP56581 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdgP56581 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdgP56581 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms