Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lim2P56563 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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