Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cox7bP56393 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms