Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms