Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms