Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NcanP55066 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NcanP55066 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NcanP55066 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NcanP55066 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NcanP55066 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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