Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms