Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RabggtbP53612 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RabggtbP53612 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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