Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms