Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apobec1P51908 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apobec1P51908 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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