Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms