Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr5P51682 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms