Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TspoP50637 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TspoP50637 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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TspoP50637 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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TspoP50637 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TspoP50637 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TspoP50637 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TspoP50637 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TspoP50637 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TspoP50637 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TspoP50637 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TspoP50637 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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