Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod1P49813 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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