Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HpdP49429 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HpdP49429 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HpdP49429 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HpdP49429 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HpdP49429 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HpdP49429 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HpdP49429 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HpdP49429 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HpdP49429 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HpdP49429 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HpdP49429 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HpdP49429 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms