Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Epb42P49222 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Epb42P49222 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Epb42P49222 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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