Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms