Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms