Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd4P46935 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd4P46935 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms