Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab11bP46638 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rab11bP46638 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rab11bP46638 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rab11bP46638 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rab11bP46638 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rab11bP46638 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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