Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdkn1bP46414 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms