Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ItgavP43406 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ItgavP43406 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms