Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms