Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sept1P42209 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sept1P42209 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sept1P42209 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms