Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd1P40201 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd1P40201 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms