Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa2P31245 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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