Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnd1P30999 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms