Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms