Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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RxrbP28704 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RxrbP28704 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RxrbP28704 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RxrbP28704 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RxrbP28704 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RxrbP28704 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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RxrbP28704 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RxrbP28704 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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