Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms