Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb1P28230 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms