Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms