Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BrafP28028 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BrafP28028 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BrafP28028 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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