Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChgaP26339 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChgaP26339 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms