Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk11bP24788 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk11bP24788 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 770.2 ms