Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd247P24161 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms