Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd12P23812 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd12P23812 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd12P23812 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms