Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkchP23298 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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