Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms