Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PparaP23204 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PparaP23204 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PparaP23204 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PparaP23204 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PparaP23204 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PparaP23204 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PparaP23204 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PparaP23204 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PparaP23204 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms